熒光濾光片廣泛應用于生化分析鄰域，熒光濾光片一般包含三片組合，即激發濾光片、二色鏡和發射濾光片。      

激發濾光片（Exciting Filter, Exciter Filter,Excitation Filter )：在熒光顯微鏡中，只有激發熒光的波長可通過的濾光片。也有直接使用激光作為激發光。      

二色鏡（Dichroic Mirror,Dichroic Beamsplitter,Dichromatic Beamsplitter）：又稱二向色濾光片或分色鏡。與顯微鏡的光路呈45°角放置。這片濾光片反射一種顏色光（激發光）并且透射另一種顏色光（發射光），激發光的反射率大于90%，發射光的透射率大于90%。光譜中不能透過的部分被反射而不是被吸收。濾光片在透射光和反射光下的顏色互為補色，因而又稱二向色濾光片。      

發射濾光片（Emitting Filter,Emission Filter ,Barrier Filter，Emitter)：選擇并傳輸樣本發出的熒光，其他范圍光線截止。發射光的波長比激發光的波長要長。可以選擇帶通濾光片或者長波通濾光片作為發射濾光片。       

常用的有與635nm激發波長680nm發射波長配套的635nm高反射率675nm~730nm高透過率的二色鏡和中心波長680nm截止深度OD5的窄帶濾光片，由于激發光采用的是氦氖激光器（波長為632.8nm），免去了激發濾光片。